概述
EMSA是检测蛋白与DNA形成复合体并直接相互作用的技术方法,可用于定性和定量分析,能够更准确的判断蛋白与DNA的特异性结合序列,因此蛋白-DNA复合体的识别在研究基因的表达调控中具有重要作用。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素或生物素标记的DNA或RNA探针共孵育,在非变性聚丙酰胺烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。DNA-复合物或RNA-复合物比非结合的探针移动得慢。当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽提液。在检测RNA结合蛋白时,依据目的RNA结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的DNA或RNA片段和寡核苷酸片段(特异),和其它非相关的片段(非特异),来确定DNA或RNA结合蛋白的特异性。在竞争的特异和非特异片段的存在下,依据复合物的特点和强度来确定特异结合。
技术路线
1、探针设计及合成及标记;
2、EMSA电泳凝胶配置;
3、EMSA结合反应;
4、紫外交联;
5、EMSA反应物电泳分析;
客户提供
1、探针序列和标记物选择(或DNA结合蛋白相关信息,由我方设计)
2、细胞处理试剂及方案或者细胞核核蛋白提取物,部分实验可用重组表达蛋白,每张膜至少提供30μg
瑞吉因提供
1、合成标记的探针及非标记探针
2、实验报告(实验步骤、主要仪器及厂家、主要试剂及厂家批号、实验结果)
3、实验记录本
4、原始图片及数据
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