LncRNA(Long noncodingsRNA)长链非编码RNA，起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II 转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，LncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记 以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，LncRNA的这些调控作用也开 始引起人们广泛的关注。虽然近年来关于LncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分LncRNA的功能仍不清楚， 随着研究的推进，各类LncRNA的大量发现，LncRNA的研究将是RNA基因组研究非常吸引人的一个方向，使 人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。

　　服务内容

　　瑞吉因生物的专家团队可以为您提供从LncRNA分析及靶基因预测，LncRNA的功能探索以及更 深层次的靶点寻找和表达调控机制探索等全方位的服务。

　　一、LncRNA与microRNA相关性分析及预测

　　1、LncRNA-mRNA/microRNA相关性分析：根据设定的阈值筛选LncRNA与mRNA/microRNA关系对， 构建LncRNA-mRNA共表达网络。

　　2、LncRNA靶基因预测：基于LncRNA与mRNA/miRNA表达相关性以及LncRNA与mRNA/microRNA基因 组位置近邻关系，得到LncRNA的潜在靶标基因。以及通过网络数据库miRCODE、CatRAPID等 进行预测LncRNA可能调控的miRNA和基因。

　　3、LncRNA功能分析：对于已知功能的LncRNA，我们对LncRNA进行功能标注。对于未知功能的 LncRNA我们预测其功能，并进行功能富集分析。

　　二、LncRNA的功能研究

        1、Gain1of1Function(体内和体外)

         2、Loss2of4Function(体内和体外)

         3、LncRNA沉默与定位分析

　　三、差异性的LncRNA的筛选

　　1、生物信息学预测

　　2、表达谱芯片检测

　　3、高通量测序

　　4、聚类分析：针对芯片结果进行样本及差异表达LncRNA和mRNA的聚类，寻找属于同一表达趋势 的基因或样本。

　　5、功能富集分析：差异基因，应用数据库进行功能富集分析，挖掘具有统计学意义的差异表达 基因的功能类别。

　　四、LncRNA的调控机制研究

　　1、表观遗传研究-DNA甲基化：利用MSP、BSP技术，研究LncRNA对DNA甲基化的调控。

　　2、表观遗传研究-染色质重塑：利用ChIP技术，研究LncRNA对染色质重塑的调控。

　　3、转录调控研究通过EMSA、RIP(下图所示)、ChIRP、Co-IP等技术，研究LncRNA与 转录因子间的相互作用。

　　RIP原理